2016年9月12日上午，福州海事局局长王华明一行3人对东南公司进行了为期3天的安全管理体系审核。审核期间，审核组审阅了东南公司安全管理体系中的船舶管理、海上运输等文件，查看文件修改情况，并验证上次审核文件不符合规定关闭情况。13日上午，审核组分成3个小组对岸基活动进行了审核，主要审查公司船岸SMS运行的有效性，并验证了上次审核活动不符合规定关闭情况。审核组综合分析审核中收集到的客观证据、汇总审核情况、评估公司安全管理体系运行的符合性、有效性，确定审核结论。审核组认为：自上次审核以来，公司船岸人员能够贯彻公司的安全和环保方针，船岸各项活动能够按照体系文件的规定进行，审核组没有发现严重和重大不符合规定情况，东南公司安全管理体系运行基本有效，通过年度审核。
  东南公司领导高度重视此次审核工作，公司总经理李诚清表示安全管理体系是公司船舶运营工作之中的重中之重，公司会及时按照审核组的要求，组织有关部门进行整改落实，全面完善体系的不足之处。